中医学院始于1968年，是学校特色学院，是“全国乡村医生中医学历教育项目基地”“中医类别国家医师资格实践技能考试基地”“全国中医药文化宣传教育基地”“全国科普教育基地”“全国研学旅行基地”“《保健服务通用要求》国家标准修订组长单位”“重庆市乡镇卫生院中医临床技术骨干培训基地”“重庆三峡国际中医药培训中心”。

学院办学实力雄厚。有专业教师300余名，其中教授（主任医师）、副教授（副主任医师）100余名；博士、硕士120余名；多人次荣获国家基层名老中医药专家、全国优秀中医临床人才、重庆市学术技术带头人、重庆市最美教师、重庆市教书育人楷模、重庆市骨干教师、重庆市优秀教育工作者、重庆市优秀思政工作者、重庆市名中医等称号。校内建有集教学、培训、技能鉴定、应用技术研究等功能为一体的专业实训基地，实训室面积7000余平方米，教学仪器设备值2200余万元。建有重庆市高水平专业化产教融合实训基地，直属附属中医院为三级医院，校外实习、教学医院90余家，企业30余家。

学院以学生为本，狠抓教学质量，近年来毕业生就业率保持在98%以上。在全国职业院校技能竞赛、首届“慧医谷杯”中医临床技能大赛、“互联网+”创新创业等竞赛中多次获得团体一等奖、二等奖、三等奖和个人奖项；中医学院团总支先后获得团中央全国高校“活力团支部”、暑期“三下乡”优秀团队等荣誉称号。1名学生荣获“全国优秀共青团员”称号。学院医学类专业毕业生参加全国中医执业助理医师资格考试，在全国高职院校中综合通过率稳居前列。